基因组测序的类型

基因组测序可以意味着对生物体的整个基因组进行测序或仅关注测序非常特异的DNA区域。

全基因组测序

全基因组测序重点介绍测序全部脱氧核糖核酸在生物体的基因组。

de novo测序(从一开始就开始)

  • 这是当有机体的整个基因组首次进行排序并组装,而没有可用性参考基因组
  • 如果你想象基因组是固定尺寸的拼图(例如,1米2),碎片越小,有的碎片,难题越难以完成。第一次组装基因组时是相同的。
  • 在基因组组装中,短和长块DNA的组合被测序,以尽可能多地覆盖基因组,并最小化在最终序列中存在任何间隙的风险。

重新开始

  • 重新排序项目是当有机体的基因组被测序并且组装使用参考基因​​组作为模板(例如,与人类这样做是由此产生的基因组人类基因组项目)。
  • 执行重置的主要原因是比较来自相同的基因组之间的差异物种

靶向基因组测序

  • 有针对性的测序意味着研究人员可以专注于在基因组内测序特定的感兴趣区域。
  • 目标测序的一个常见用途是寻找单核苷酸多态性(SNPS)。SNP是DNA序列中的单碱基变化。它们是最常见的类型遗传变异在我们之间,可以用来帮助科学家找到基因与疾病有关。
  • 在靶向测序期间,所研究的DNA序列被称为所谓的过程放大聚合酶链反应(PCR)。
  • 在扩增序列后,通过高通量测序对DNA进行测序。
  • 有针对性的测序降低测序项目所需的成本和时间,并允许对基因组的特定区域进行更深入的研究。

exome pulldown.

  • Exome.测序是一种靶向测序,其中研究人员仅序列仅在基因组中的基因。
  • 基因占人类基因组的少于2%。因此,有时研究人员只关注它们的测序努力,只在基因上(exome)。
  • Exome包含所需的所有说明蛋白质在你的身体里。
  • 由于外显子组测序只研究了基因组的一个非常小的部分,它使科学家能够专注于DNA序列中更有可能与疾病相关的部分,基因。
  • 比整个基因组测序,exme更快和更便宜。

在exome下拉期间,磁珠用于拉出感兴趣的DNA序列。
图像信用:Genome Research Limited

此页面的最后更新于2015-02-25